幸好宋江认出武松，将其救下，孔明兄弟与武松消除误会后热情招待，之后宋江与武松一同离去。
落草白虎山：孔太公死后，孔明兄弟与本乡一个财主生争执，竟将财主满门良贱全部杀死。
因官府捕捉甚紧，他们只得反上白虎山，聚集了五七百人，打家劫舍。
但叔父孔宾却因居住在青州城内，被知府慕容彦达捉下，监在牢中。
攻打青州：
孔明、孔亮点起山寨喽啰攻打青州，欲营救孔宾。
当时呼延灼正带兵征剿桃花山的李忠、周通，闻讯回师青州，在城下与白虎山兵马相遇。
孔明出马迎战呼延灼，却因武艺不精，被呼延灼活捉，呼延灼又纵兵掩杀，大败孔亮。
慕容彦达将孔明打入大牢，与孔宾一同收监。
孔亮败逃途中，遇到二龙山的鲁智深、武松等人，请他们出兵搭救兄长。
鲁智深聚集二龙山、白虎山、桃花山三寨兵马，联兵攻打青州，并让孔亮上梁山求援。
宋江亲自率军下山，会合三山兵马，降服呼延灼，攻破青州，将孔明、孔宾救出。
梁山聚义：
孔明兄弟遂与鲁智深、李忠等三山头领一同加入梁山。
宋江继任梁山寨主后，命孔明兄弟与燕顺、郑天寿一同把守金沙滩小寨。
智取大名府时，孔明兄弟扮作乞丐，混入城中为内应，并闯入司狱司，救出卢俊义、石秀。
梁山排座次时，孔明排第六十二位，星号地猖星，与孔亮一同担任守护中军步军骁将，居住在忠义堂西边房内。
两赢童贯时，孔明兄弟在九宫八卦阵中位于中军阵，统领二十四名铁甲军士，协助焦挺守护中军帅字旗。
南征北战：
征讨辽国：担任呼延灼的副将，攻破太乙混天象阵中的火星阵。
征讨田虎：具体事迹记载较少，但也参与了梁山的征战。
征讨王庆：参与南丰之战，在九宫八卦阵中担任护旗将士。
人物结局：在征讨方腊时，孔明随李俊、穆弘到润州作内应，协助大军攻破润州，并与孔亮合擒守将卓万里。
后随李应前往江阴、太仓等处，协助水军作战，收复沿海县治。
杭州之战时与李应、杨林等人一同负责“管领各寨探事，各处策应”
。
最终因感染瘟疫，被寄留在杭州，未能继续随军征战，在杭州病逝，追封义节郎。
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